妙云集

1. 般若经讲记
2. 中观今论
3. 净土与禅
4. 宝积经讲记
5. 唯识学探源
6. 青年之佛教
7. 胜謦经讲记
8. 性空学探源
9. 我之宗教观
10. 药师经讲记
11. 成佛之道(增注本)
12. 无诤之辩
13. 中观论颂讲记
14. 太虚大师年谱
15. 教制教典与教学
16. 摄大乘论讲记
17. 佛在人间
18. 佛教史地考论
19. 大乘起信论讲记
20. 学佛三要
21. 华雨香云
22. 佛法概论
23. 以佛法研究佛法
24. 平凡的一生(增订本)
25. 佛法是救世之光

1. 华雨集(一)
2. 华雨集(二)
3. 华雨集(三)
4. 华雨集(四)
5. 华雨集(五)

其他专门研究

1. 空之探究
2. 印度佛教思想史
3. 中国禅宗史
4. 原始佛教圣典之集成
5. 如来藏之研究
6. 印度之佛教
7. 杂阿含经论会编(上)
8. 杂阿含经论会编(中)
9. 杂阿含经论会编(下)
10. 杂阿含经部类之整编
11. 说一切有部为主的论师与论书之研究
12. 初期大乘佛教之起源与开展

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